La comprensión de la relación estructura-propiedades es fundamental en el estudio de química en las ciencias agropecuarias. En ese sentido y a partir de las dificultades observadas en los alumnos para la aplicación de ese núcleo conceptual, se identificó la noción básica efectos electrónicos en las moléculas y se planteó la investigación de su construcción conceptual. Se utilizaron en este estudio dos instrumentos metodológicos: cuestionario y entrevista semiestructurada con modalidad clínica. Se detectaron ciertos obstáculos epistemológicos en la argumentación de los alumnos. Éstos fueron: la tendencia a la generalización, el empirismo inmediato y los modelos simplistas, que actuarían bloqueando el pensamiento profundo. Concluímos que el aprendizaje de la noción efectos electrónicos en las moléculas requiere del despliegue de toda su complejidad epistemológica.

The understanding of the structure-properties relation is of great importance in the chemistry study in Agricultural Sciences. In this sense, starting from the difficulties found in students when applying this conceptual nucleus, we identified the basic notion molecular electronic effects and proposed the research of its conceptual construction. In this study, two methodologies were applied: questionnaire and clinical semistructured interview. The answers and the arguments of the students showed certain epistemological obstacles. These were: the tendency to generalization, the immediate empiricism and the simplistic models that would act blocking the profound thoughts. We concluded that the learning of the notion: molecular electronic effects needs to display its overall epistemological complexity.