Nas últimas décadas, o desenvolvimento da biologia molecular tem impulsionado a medicina, principalmente na identificação de novos alvos terapêuticos e de diagnóstico. Nas células são as proteínas as principais intervenientes responsáveis pelo funcionamento de todos os processos celulares, desde a síntese de novas moléculas de DNA, à formação de RNA e de novas proteínas, ao transporte de todos os componentes celulares bem como da composição estrutural da própria célula. Também são as proteínas um dos componentes mais relevantes das vias de sinalização entre as células. Estudos apontam para que, normalmente, as proteínas não funcionem sozinhas mas em complexos. Daí a importância de estudar as interações entre proteínas e, por outro lado, encontrar compostos que interfiram com esses complexos para tratamentos farmacológicos. Já existem alguns fármacos com estas características. A tricostatina A, um inibidor duma diacetilase de histonas (DH), atua no complexo Proteína Fosfatase 1-DH, sendo um bom alvo na terapia anti-cancerígena. Em 1989, de um modo revolucionário para a época, Fields e Songs desenvolveram o Yeast Two Hybrid system (YTH). Este método baseia-se na genética da levedura Saccharomyces cerevisiae para detetar interações entre proteínas. Desde a sua descoberta sofreu várias modificações que permitiram a sua aplicação à investigação translacional. Por exemplo, esta técnica permite fazer um rastreio em larga escala para determinar que droga pode interferir com uma determinada interação proteica. Por outro lado, pode também utilizar-se para se determinar que proteínas num determinado tecido (por exemplo, cérebro ou testículo) interagem com a nossa proteína de interesse. Deste modo é possível desvendar funções de novas proteínas, vias de sinalização e funcionamento de tecidos. A grande quantidade de informação produzida por esta abordagem é de eleição para a identificação e validação de alvos de diagnóstico, terapêuticos e mesmo desenvolvimento de novos fármacos. Esta revisão tem como intuito elucidar o funcionamento do Yeast Two Hybrid system e a sua contribuição para a identificação de novos tratamentos farmacológicos.