El Departament de Cirurgia coordina els ensenyaments de les àrees de coneixement de Cirurgia, Oftalmologia, Otorinolaringologia, Traumatologia i Ortopèdia i Urologia.

És un departament estructurat en Unitats disperses geogràficament a les Unitats Docents Hospitalàries: Unitat departamental Sant Pau, Unitat departamental Vall Hebron, Unitat departamental Hospital del Mar, Unitat departamental Hospital Germans Trias i Pujol i Unitat departamental Parc Taulí.