Els avenços en tècniques de genotipat de polimorfismes genètics a gran escala estan liderant una revolució en el camp de l’epidemiologia genètica i la genètica de poblacions humanes. La informació aportada per aquestes tècniques ha evidenciat l’existència d’estructuracions poblacionals que poden augmentar l’error en els estudis d’associació a escala genòmica (GWAS, genome-wide association studies). Estudis recents han demostrat la presència d’aquestes estructuracions a nivell interregional i intrarregional a Europa. El present projecte ha avaluat el grau d’estructuració genètica en poblacions de la Península Ibèrica i altres regions del sudoest europeu (Itàlia i França) per quantificar l’impacte que aquesta potencial estructuració pot tenir en el disseny d’estudis d’associació GWAS i reconstruir la història demogràfica de les poblacions de la Mediterrània. Per aconseguir aquests objectius, s’han analitzat mostres de DNA de 770 individus de 26 poblacions de la Península Ibèrica, França, Itàlia i d’altres països de la Mediterrània. Aquestes mostres van ser genotipades per 240000 SNPs utilitzant l’array 250K StyI d’Affymetrix en el marc d’aquest projecte o mitjançant altres arrays d’Affymetrix en els projectes internacionals HapMap i POPRES. S’han realitzat anàlisis estadístiques incloent anàlisis de components principals, Fst, identitat per descendència, desequilibri de lligament, barreres genètiques, etc. Aquests resultats han permés construir un marc de referència de la variabilitat en aquesta regió, avaluar el seu impacte en estudis d’associació i proposar mesures per evitar l’increment de qualsevol tipus d’error (tipus I i II) en estudis nacionals i internacionals. A més, també han permés reconstruir la història de les poblacions humanes de la Mediterrània així com analitzar les seves relacions demogràfiques. Donada la duració limitada d’aquesta acció (24 mesos, d’octubre de 2010 a setembre de 2012), els resultats d’aquest projecte es troben actualment en fase de redacció i conduiran a diverses publicacions en revistes internacionals i a la preparació de comunicacions a congressos.

Advances in high-throughput genotyping platforms are leading a revolution in the fields of genetic epiemiology and human population genetics. The information generated by these techniques have revealed the existance of population substructures that can increase error rates in genome-wide association studies (GWAS). Recent studies have demonstrated the presence of these structures between and within regions across Europe. The present project has evaluated the degree of population structure in populations from the Iberian Peninsula and other regions in Southwest Europe (Italy and France) to quantify the impact of the potential population structuration on the design of GWAS and to reconstruct the demographic history of Mediterranean populations.To achieve these goals, 770 DNA samples from individuals in 26 populations from the Iberian Peninsula, Italy, France and other countries in the Mediterranean Basin have been analyzed. These samples were genotyped uisng the 250K StyI Affymetrix array in the framework of this project or using other Affymetrix arrays in the HapMap and POPRES international projects. The statistical analyses have included principal component analysis, Fst, identity by descent, linkage disequilibrium patterns, genetic barriers, etc. These results have allowed the characterization of genetic variability in this region, the evaluation of its impact on association studies and the ellaboration of proposals to avoid increases in error rates (either Type I or II) in national and international studies. Moreover, they have also allowed the reconstruction of the history of human populations in the Mediterranean and the analysis of their demogrpahic relationships. Given the limited duration of this action (24 months, from October 2010 to September 2012), the results of this project are currently being prepared and will lead to several publications and communications to scientific meetings.