dc.contributor |
Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Matemàtica Aplicada I |
dc.contributor |
Casanellas Rius, Marta |
dc.contributor |
Fernández, Jesús |
dc.contributor.author |
Sabaté Vidales, Marc |
dc.date |
2014-01 |
dc.identifier.uri |
http://hdl.handle.net/2099.1/20844 |
dc.language.iso |
eng |
dc.publisher |
Universitat Politècnica de Catalunya |
dc.rights |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
dc.subject |
Àrees temàtiques de la UPC::Matemàtiques i estadística |
dc.subject |
Biomathematics |
dc.subject |
Phylogenetic trees |
dc.subject |
Svd |
dc.subject |
Neighbor-Joining |
dc.subject |
Quartet Puzzling |
dc.subject |
Weight Optimization |
dc.subject |
Willson |
dc.subject |
Cofrobtail |
dc.subject |
Biomatemàtica |
dc.subject |
Classificació AMS::92 Biology and other natural sciences::92B Mathematical biology in general |
dc.title |
Reconstruction of phylogenetic trees using quartet methods |
dc.title |
Reconstrucció filogenètica basada en quarterts |
dc.type |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
dc.description.abstract |
Els arbres filogenètics ajuden a modelitzar l'evolució de les espècies. En aquests arbres, les fulles representen les espècies actuals, l'arrel representa l'ancestre comú a totes aquestes espècies i cada branca un procés d'especiació. Per a poder inferir les relacions filogenètiques d'un conjunt d'espècies actuals, podem aspirar a conèixer el genoma d'aquestes espècies, tot i que no disposem d'informació del genoma dels ancestres d'aquestes espècies. Existeix un bon nombre de mètodes de reconstrucció filogenètica. En aquest treball, hem implementat i hem analitzat els resultats de 12 mètodes de reconstrucció per quartets. En aquests mètodes, donat un conjunt d'espècies actuals, s'infereixen les relacions filogenètiqes entre tots els subconjunts de 4 espècies dins del conjunt original, i a continuació es combina tota aquesta informació per a construir l'arbre filogenètic resultant. . Tècniques algebraiques desenvolupades recentment permeten usar el rang de certes matrius per a reconstruir l'arbre filogenètic d'un conjunt d'espècies. En aquest projecte s'usaran aquestes tècniques dins de mètodes de reconstrucció filogenètica basats en quartets. S'implementaran diferents mètodes de quartets i es faran tests per avaluar l'eficàcia dels mètodes |