Optimization methods for individual-based model parameter estimation in predictive microbiology

Inici | Què és? | Contacte

English | Castellano

Consultar RECERCAT

Per comunitats i
col·leccions Per data Per autors Per títols Per matèries

Consultar col·lecció

Per data Per autors Per títols Per matèries

Estadístiques

Del document Tot RECERCAT

El meu RECERCAT

Entrar Alertes per correu-e

Directori d’altres repositoris

Pàgina inicial del RECERCAT > Universitat Politècnica de Catalunya > Documents de recerca > Visualitza document

Per accedir als documents amb el text complet, si us plau, seguiu el següent enllaç: http://hdl.handle.net/2117/13753

dc.contributor	Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Física i Enginyeria Nuclear
dc.contributor	Universitat Politècnica de Catalunya. SC-SIMBIO - Sistemes complexos. Simulació discreta de materials i de sistemes biològics
dc.contributor.author	Prats Soler, Clara
dc.contributor.author	Bernaerts, K.
dc.contributor.author	Standaert, A.
dc.contributor.author	Ferrer Savall, Jordi
dc.contributor.author	López Codina, Daniel
dc.contributor.author	Van Impe, J.
dc.date	2009
dc.identifier.citation	Prats, C. [et al.]. Optimization methods for individual-based model parameter estimation in predictive microbiology. A: Vienna Conference on Mathematical Modelling. "6th Vienna Conference on Mathematical Modelling". Viena: 2009, p. 2635-2638.
dc.identifier.citation	9783901608353
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/2117/13753
dc.language.iso	eng
dc.relation	http://cataleg.upc.edu/record=b1292393~S1*cat
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subject	Àrees temàtiques de la UPC::Enginyeria agroalimentària::Ciències de la terra i de la vida::Microbiologia
dc.subject	Parameter estimation
dc.subject	Microorganisms
dc.subject	Estimació paramètrica
dc.subject	Microorganismes
dc.title	Optimization methods for individual-based model parameter estimation in predictive microbiology
dc.type	info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type	info:eu-repo/semantics/conferenceObject
dc.description.abstract	In the framework of microbiology, Individual-based Models are discrete models in which the main entities are microbes. Their use in simulations as ‘virtual experiments’ to predict the evolution of populations under specific conditions requires accurate setting of the parameters involved. We adapted and tested two optimization methods for Individual-based Model parameter estimation: the Nelder-Mead Threshold Accepting (NMTA) and the NEWUOA. These methods presented no convergence problems, and the best results in terms of time expenditure were derived with the latter.
dc.description.abstract	Peer Reviewed

Mostra el registre simple del document

Documents relacionats

Altres documents del mateix autor/a

Mathematical modelling methodologies in predictive food microbiology: a SWOT analysis

Ferrer Savall, Jordi; Prats Soler, Clara; López Codina, Daniel; Vives Rego, Josep

Analysis of the population structure of Plasmodium falciparum-infected erythrocytes

Ferrer Savall, Jordi; Prats Soler, Clara; López Codina, Daniel; Gargallo-Viola, Domingo; Valls Ribas, Joaquim

Analysis and IbM simulation of the stages in bacterial lag phase: basis for an updated definition

Prats Soler, Clara; Giró Roca, Antoni; Ferrer Savall, Jordi; López Codina, Daniel; Vives-Rego, J

Individual-based modelling of bacterial cultures to study the microscopic causes of the lag phase

Prats Soler, Clara; López Codina, Daniel; Giró Roca, Antoni; Ferrer Savall, Jordi; Valls Ribas, Joaquim

Individual-based modelling: an essential tool for microbiology

Ferrer Savall, Jordi; Prats Soler, Clara; López Codina, Daniel

Accessibilitat | Avís legal | Política de Cookies | Documents d'ús intern

Coordinació

Patrocini