Título:
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Una herramienta basada en teoría de grafos y teoría de la información para la caracterización del entorno de interacción de un conjunto de proteínas
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Autor/a:
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Massanet Vila, Raimon; Gallardo Chacón, Joan Josep; Caminal Magrans, Pere; Perera Lluna, Alexandre
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Otros autores:
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Universitat Politècnica de Catalunya. Departament d'Enginyeria de Sistemes, Automàtica i Informàtica Industrial; Universitat Politècnica de Catalunya. SISBIO - Senyals i Sistemes Biomèdics |
Abstract:
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En los últimos años se han acumulado grandes cantidades de información genética, proteinómica y metabólica en bases de datos públicas y privadas. Se ha dedicado un gran esfuerzo al desarrollo de herramientas capaces de explotar, estructurar y organizar esta información para poder sacar partido de ella. Sin embargo, a día de hoy no existe ninguna aplicación que caracterice el entorno en el que una
proteína o conjunto de proteínas actúa. En este trabajo se ha desarrollado un paquete de software que consulta, de forma masiva, bases de datos publicas, como Gene Ontology Annotation (GOA) y Human Proteome Resource Database (HPRD) y presenta la información en ellas contenida
de forma que pueda ser fácil y rápidamente interpretada por personas pertenecientes al entorno clínico y no familiarizadas con el uso de bases de datos. Para ello presenta al usuario un conjunto de grupos de proteínas que forman parte del entorno de interacción local del conjunto inicial de proteínas y que forman subredes de alta conectividad. Además describe con etiquetas semánticas los aspectos particulares de cada grupo. |
Abstract:
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Peer Reviewed |
Materia(s):
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-Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Aplicacions de la informàtica::Bioinformàtica -Genes -- Diseases -- Mathematical models -Gens -- Malalties -- Models matemàtics |
Derechos:
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Tipo de documento:
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Artículo - Borrador Objeto de conferencia |
Editor:
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UNIVERSIDAD CARLOS III DE MADRID
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