2026-04-13T01:57:07Zhttps://recercat.cat/oai/requestoai:recercat.cat:2117/4393882025-07-29T23:24:55Zcom_2072_1033col_2072_452951
RECERCAT
author
Luna Lucio, Jennifer Jaquel
2025-06-10
Peach (Prunus persica) is a crop of great economic and agronomic importance in temperate regions. However, its susceptibility to diseases such as powdery mildew, caused by the fungus Podosphaera pannosa, negatively affects fruit quality and nursery production. Although fungicides are commonly used for its control, their intensive application leads to negative environmental impacts. A sustainable alternative is the development of resistant varieties through the introgression of resistance genes from wild species, which would reduce the use of chemical inputs and contribute to a lower environmental impact in agriculture. Prunus davidiana, a wild relative of peach, shows natural resistance to powdery mildew. The aim of this study was to identify and narrow down the genomic position of the resistance gene, named Vr4, through fine mapping. For this purpose, individuals from the NT2BaS1 population,obtained by self- pollination of second-generation (BC2) interspecific hybrids between P. persica and P. davidiana, were used. A total of 670 individuals were genotyped using flanking single nucleotide polymorphism (SNP) markers defined based on the candidate region identified in previous studies, which enabled the selection of 15 informative recombinants. In addition, these individuals were phenotyped to correlate genotype with resistance to powdery mildew. The candidate region previously defined spanned 344 kb, between positions 4,133,341 bp and 4,477,235 bp. As a result of this study, the candidate region was reduced to 68 kb, between positions 4,133,341 bp and 4,201,835 bp. This narrowing allowed the number of candidate genes to be reduced from 23 to 9. These results provide a solid foundation for future studies aimed at the precise identification of the Vr4 gene. The newly defined interval will allow for the design and use of more specific markers within this region, facilitating its localization and subsequent incorporation into breeding programs focused on developing powdery mildew resistant peach varieties.El presseguer (Prunus persica) és un cultiu de gran importància econòmica i agronòmica a les regions temperades. No obstant això, la seva susceptibilitat a malalties com l'oïdi, causada pel fong Podosphaera pannosa, afecta negativament la qualitat de la collita i la producció en viver. Tot i que els fungicides s'utilitzen habitualment per al seu control, l'ús intensiu d'aquests productes comporta impactes ambientals negatius. Una alternativa sostenible és el desenvolupament de varietats resistents mitjançant la introgresió de gens de resistència presents en espècies silvestres, fet que permetria reduir l'ús de productes químics i contribuir a una agricultura amb menor impacte ambiental. Atès quePrunus davidiana, una espècie silvestre emparentada amb el presseguer, presenta resistència natural a l'oïdi, l'objectiu d'aquest treball ha estat identificar i delimitar la posició del gen responsable, anomenat Vr4, mitjançant un mapeig fi. Per a això, s'han utilitzat individus de la població NT2BaS1, obtinguda per autopol·linització d'híbrids interespecífics de segona generació (BC2) entre P. persica i P. davidiana. Aquesta reducció ha permès reduir el nombre de gens candidats de23a9gens. S'han genotipat 670 individus utilitzant marcadors single nucleotide polymorphism (SNP) flanquejants, definits segons la regió candidata establerta en estudis previs, cosa que ha permès seleccionar 15 recombinants. A més, s'ha realitzat el fenotipat d'aquests individus per correlacionar el genotip amb la resistència a l'oïdi. La regió inicialment delimitada comprenia 344 kb, entre les posicions 4.133.341 pb i 4.477.235 pb. Gràcies a aquest treball, s'ha aconseguit reduir la regió candidata a 68 kb, entre les posicions 4.133.341 pb i 4.201.835 pb. Aquests resultats constitueixen una base per a futurs estudis centrats en la identificació del gen Vr4. La nova regió delimitada permetrà dissenyar i utilitzar marcadors més específics dins d'aquest interval, fet que en facilitarà la localització i la posterior incorporació en programes de millora genètica dirigits al desenvolupament de varietats de presseguer resistents a l'oïdi.El melocotonero (Prunus persica) es un cultivo de gran importancia económica y agronómica en regiones templadas. Sin embargo, su susceptibilidad a enfermedades como el oídio, causado por el hongo Podosphaera pannosa, afecta negativamente el rendimiento y la calidad de la cosecha. Aunque los fungicidas se emplean comúnmente para su control, su uso intensivo conlleva impactos ambientales negativos. Una alternativa sostenible es el desarrollo de variedades resistentes, mediante la introgresión de genes de resistencia presentes en especies silvestres, lo que permitiría reducir el uso de productos químicos y contribuir a una agricultura con menor impacto ambiental. Dado que Prunus davidiana, una especie silvestre emparentada con el melocotonero, presenta resistencia natural al oídio, el objetivo de este trabajo fue identificar y acotar la posición del gen responsable, denominado Vr4, mediante un mapeo fino. Para ello, se utilizaron individuos de la población NT2BaS1, obtenida por autopolinización de híbridos interespecíficos de segunda generación (BC2) entre P. persica y P. davidiana. Se genotiparon 670 individuos utilizando marcadores single nucleotide polymorphism (SNP) flanqueantes definidos según la región candidata obtenida en estudios previos, lo que permitió seleccionar 15 recombinantes. Además, se realizó el fenotipado de dichos individuos para correlacionar el genotipo con la resistencia al oídio. La región inicialmente delimitada comprendía 344 kb, entre las posiciones 4.133.341 pb y 4.477.235 pb. Gracias a este trabajo, se logró reducir la región candidata a 68 kb, entre las posiciones 4.133.341 pb y 4.201.835 pb. Esta reducción permitió disminuir el número de genes candidatos de 23 a 9 genes. Estos resultados constituyen una base para futuros estudios enfocados en la identificación del gen Vr4. La nueva región delimitada permitirá diseñar y utilizar marcadores más específicos dentro de este intervalo, lo que facilitará su localización y posterior incorporación en programas de mejora genética dirigidos al desarrollo de variedades de melocotonero resistentes al oídio.Objectius de Desenvolupament Sostenible::13 - Acció per al ClimaObjectius de Desenvolupament Sostenible::7 - Energia Assequible i No Contaminant
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ Open Access
Àrees temàtiques de la UPC::Enginyeria agroalimentària
Plant breeding
Fungal diseases of plants
Millora genetica
Oïdi
Mapeo fino
Préssec
Melocotonero (Prunus persica)
Hongo Podosphaera pannosa
Vr4 gene
Single nucleotide polymorphism (SNP)
Fine mapping
Plantes--Millora genètica
Plantes--Malalties fúngiques
Mapeo fino del gen de resistencia al oídio Vr4 en híbridos interespecíficos de Prunus persica y Prunus davidiana
Bachelor thesis