2026-04-17T15:57:27Zhttps://recercat.cat/oai/request

oai:recercat.cat:2099.1/208442025-07-23T01:32:15Zcom_2072_1033col_2072_452951

Reconstruction of phylogenetic trees using quartet methods Reconstrucció filogenètica basada en quarterts Sabaté Vidales, Marc Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Matemàtica Aplicada I Casanellas Rius, Marta Fernández, Jesús Àrees temàtiques de la UPC::Matemàtiques i estadística Biomathematics Phylogenetic trees Svd Neighbor-Joining Quartet Puzzling Weight Optimization Willson Cofrobtail Biomatemàtica Classificació AMS::92 Biology and other natural sciences::92B Mathematical biology in general Els arbres filogenètics ajuden a modelitzar l'evolució de les espècies. En aquests arbres, les fulles representen les espècies actuals, l'arrel representa l'ancestre comú a totes aquestes espècies i cada branca un procés d'especiació. Per a poder inferir les relacions filogenètiques d'un conjunt d'espècies actuals, podem aspirar a conèixer el genoma d'aquestes espècies, tot i que no disposem d'informació del genoma dels ancestres d'aquestes espècies. Existeix un bon nombre de mètodes de reconstrucció filogenètica. En aquest treball, hem implementat i hem analitzat els resultats de 12 mètodes de reconstrucció per quartets. En aquests mètodes, donat un conjunt d'espècies actuals, s'infereixen les relacions filogenètiqes entre tots els subconjunts de 4 espècies dins del conjunt original, i a continuació es combina tota aquesta informació per a construir l'arbre filogenètic resultant. . Tècniques algebraiques desenvolupades recentment permeten usar el rang de certes matrius per a reconstruir l'arbre filogenètic d'un conjunt d'espècies. En aquest projecte s'usaran aquestes tècniques dins de mètodes de reconstrucció filogenètica basats en quartets. S'implementaran diferents mètodes de quartets i es faran tests per avaluar l'eficàcia dels mètodes 2014-01 Master thesis https://hdl.handle.net/2099.1/20844 eng Restricted access - author's decision application/pdf Universitat Politècnica de Catalunya