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Identificación de variedades de vitis vinifera procedentes de diferentes regiones del mundo mediante tècnica de biologia molecular de los microsatéllites
Baig Caimi, Catalina
Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca
El objetivo de este estudio se centró en analizar una colección privada de germoplasma de Vitis vinifera L., de 338 cultivares procedentes de 24 países, para caracterizarlas creando una base de datos, utilizando 11 marcadores microsatélites o SSR (Simple Sequence Repeat). Como resultado se encontraron que algunas de las muestras analizadas presentaron un perfil idéntico de SSR, indicando que se trata de una sinonimia (la misma variedad pero con diferente nombre). Se detectaron 293 perfiles únicos. Adicionalmente, 15 pares de variedades presentaron diferencias en un solo locus y otros 7 grupos difieren en 2 loci, lo cual indicaría la alta proximidad genética entre esas variedades, sin llegar a ser la misma. El germoplasma analizado cuenta con una compleja biodiversidad varietal que se debe preservar. El estudio se realizó programando para el primer año la revisión bibliográfica detallada, recolección de las hojas y el inicio de la puesta a punto de la metodología, en el segundo año se completa la puesta a punto de la metodología, se trituran las hojas y se realiza la extraccinón del ADN. El tercer año se emplea para amplificar los fragmentos de ADN por medio de la PCR (reacción en cadena de la polimerasa), obtener la longitud de los fragmentos con un secuenciador ABI PRISM 310, valorar resultados y realizar repeticiones. El último año se analizan los resultados obtenidos, se realizan repeticiones pertinentes y se comienza la redacción de artículos científicos.
The main objective of this study was analyze a private collection of germplasm of Vitis vinifera L., with 338 varieties from 24 different countries, to characterize them and create a data base, using 11 microsatellites makers or SSR (Simple Sequence Repeat). AS a result, some of the analyzed samples presented an identical SSR profile, indicating that is a sinonimia (the same variety but with different name). Only 293 unique profiles were detected. Additional, 15 par of varieties were different in one locus and other 7 groups differ in 2 loci, which would indicate the high genetic proximity among these varieties, without to be the same. The analyzed germoplasma has a complex biodiversity varietal that it is necessary to preserve. The study was realized programming for the first year a bibliographical review, recollection of leaves aid the beginning of the methodology, in the second year was completed the methodology, leaves were crushed and the extraction of the DNA was realized. The third year was used lo amplify fragments of DNA by PCR (chain reaction of the polimerasa), to obtain the length of the fragments with a sequencer ABI PRlSM 310, to value results and to realize repetitions. Last year, results obtained was analyzed, pertinent repetitions were realized and started the redaction of scientific articles.
19-01-2011
575 - Genètica general. Citogenètica general. Immunogenètica. Evolució. Filogènia
Vinyes -- Genètica
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13 p.
Informe
Els ajuts de l'AGAUR;2008FIC00282
         

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