Para acceder a los documentos con el texto completo, por favor, siga el siguiente enlace: http://hdl.handle.net/2117/28347

Reducing the n-gram feature space of class C GPCRs to subtype-discriminating patterns
König, Caroline; Alquézar Mancho, René; Vellido Alcacena, Alfredo; Giraldo Arjonilla, Jesús
Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Ciències de la Computació; Universitat Politècnica de Catalunya. VIS - Visió Artificial i Sistemes Intel.ligents; Universitat Politècnica de Catalunya. SOCO - Soft Computing
G protein-coupled receptors (GPCRs) are a large and heterogeneous superfamily of receptors that are key cell players for their role as extracellular signal transmitters. Class C GPCRs, in particular, are of great interest in pharmacology. The lack of knowledge about their full 3-D structure prompts the use of their primary amino acid sequences for the construction of robust classifiers, capable of discriminating their different subtypes. In this paper, we investigate the use of feature selection techniques to build Support Vector Machine (SVM)-based classification models from selected receptor subsequences described as n-grams. We show that this approach to classification is useful for finding class C GPCR subtype-specific motifs.
Peer Reviewed
Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Intel·ligència artificial
Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Aplicacions de la informàtica::Bioinformàtica
Protein research
G protein-coupled receptors
GPCRs
Support vector machine-based classification
SVM-based classification
Proteïnes -- Investigació
Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Spain
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
Artículo
         

Mostrar el registro completo del ítem

Documentos relacionados

Otros documentos del mismo autor/a

König, Caroline; Alquézar Mancho, René; Vellido Alcacena, Alfredo; Giraldo Arjonilla, Jesús
König, Caroline; Cruz Barbosa, Raúl; Alquézar Mancho, René; Vellido Alcacena, Alfredo
Cárdenas Dominguez, Martha Ivón; Vellido Alcacena, Alfredo; Giraldo Arjonilla, Jesús
Sanromà Güell, Gerard; Alquézar Mancho, René; Serratosa Casanelles, Francesc