Para acceder a los documentos con el texto completo, por favor, siga el siguiente enlace: http://hdl.handle.net/2099.1/16165

Motif discovery using optimized suffix tries
Prado Martínez, Sergio
Witte, Dieter De
Motif discovery is a challenging problem from a computational point of view [5] [6]. Binding sites are better conserved in DNA because they have a biological function and are therefore under selective pressure. Motif discovery algorithms can help us detect them. To tackle our problem we design and implement an index structure and a motif discovery algorithm. In this thesis we will investigate memory and performance optimizations.
En el present article es presenta una implementació d'un Suffix Trie optimitzat. Nosaltres explicarem el seu disseny i presentarem un algorisme per Motif Discovery.
Àrees temàtiques de la UPC::Informàtica::Aplicacions de la informàtica::Bioinformàtica
Computer algorithms
DNA
suffix trie
motif discovery
degeneracy
Algorismes genètics
ADN
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
Universitat Politècnica de Catalunya;
Universiteit Gent
         

Mostrar el registro completo del ítem