http://www.recercat.cat:80/handle/2072/1761 Sat, 11 Feb 2012 21:23:28 GMT 2012-02-11T21:23:28Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179684 Genomics of wine yeast: functional analysis of new and variable genes Novo Molinero, Maite Saccharomyces cerevisiae ha estat el llevat utilitzat durant mil.lenis en l'elaboració de vins. Tot i així, es té poc coneixement sobre les pressions de selecció que han actuat en la modelització del genoma dels llevats vínics. S’ha seqüenciat el genoma d'una soca vínica comercial, EC1118, obtenint 31 supercontigs que cobreixen el 97% del genoma de la soca de referència, S288c. S’ha trobat que el genoma de la soca vínica es diferencia bàsicament en la possessió de 3 regions úniques que contenen 34 gens implicats en funcions claus per al procés fermentatiu. A banda, s’han dut a terme estudis de filogènia i synteny (ordre dels gens) que mostren que una d'aquestes tres regions és pròxima a una espècie relacionada amb el gènere Saccharomyces, mentre que les altres dos regions tenen un origen no-Saccharomyces. S’ha identificat mitjançant PCR i seqüenciació a Zygosaccharomyces bailii, una espècie contaminant de les fermentacions víniques, com a espècie donadora d'una de les dues regions. Les hibridacions naturals entre soques de diferents espècies dins del grup Saccharomyces sensu stricto ja han estat descrites. El treball és el primer que presenta hibridacions entre espècies Saccharomyces i no-Saccharomyces (Z. bailii, en aquest cas). També s’assenyala que les noves regions es troben freqüent i diferencialment presents entre els clades de S. cerevisiae, trobant-se de manera gairebé exclusiva en el grup de les soques víniques, suggerint que es tracta d'una adquisició recent de transferència gènica. En general, les dades demostren que el genoma de les soques víniques pateix una constant remodelació mitjançant l'adquisició de gens exògens. Els resultats suggereixen que aquests processos estan afavorits per la proximitat ecològica i estan implicats en l'adaptació molecular de les soques víniques a les condicions d'elevada concentració en sucres, poc nitrogen i elevades concentracions en etanol.; Report for the scientific sojourn at the Institut National de la Recherche Agronomique, France, from 2007 to 2009. Saccharomyces cerevisiae has been used for millennia in winemaking, but little is known about the selective forces acting on the wine yeast genome. It has been sequenced the complete genome of the diploid commercial wine yeast EC1118, resulting in an assembly of 31 scaffolds covering 97% of the S288c reference genome. The wine yeast differed strikingly from the other S. cerevisiae isolates in possessing three unique large regions, two of which were subtelomeric, the other being inserted within an EC1118 chromosome. These regions encompass 34 genes involved in key wine fermentation functions. Phylogeny and synteny analyses are carried out during the second fellowship year and showed that one of these regions originated from a species closely related to the Saccharomyces genus, whereas the two other regions were of non-Saccharomyces origin. It has been identified Zygosaccharomyces bailii, a major contaminant of wine fermentations, as the donor species for one of these two regions. Although natural hybridization between Saccharomyces strains has been described, the research provides evidence that gene transfer may occur between Saccharomyces and non-Saccharomyces species. It is shown that the regions identified are frequent and differentially distributed among S. cerevisiae clades, being found almost exclusively in wine strains, suggesting acquisition through recent transfer events. Overall, these data show that the wine yeast genome is subject to constant remodelling through the contribution of exogenous genes. The results suggest that these processes are favoured by ecologic proximity and are involved in the molecular adaptation of wine yeasts to conditions of high sugar, low nitrogen, and high ethanol concentrations Fri, 01 Jan 2010 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179684 2010-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179683 Target-guided synthesis of metal-based phosphatase inhibitors Angurell Purroy, Inmaculada Report for the scientific sojourn at the Imperial College of London, United Kingdom, from 2007 to 2009. PTEN is a tumour suppressor enzyme that plays important roles in the PI3K pathway which regulates growth, proliferation and survival and is thus related to many human disorders such as diabetes, neurodegenerative diseases, cardiovascular complications and cancer. It is hence of great interest to understand in detail its molecular behaviour and to find small molecules that can switch on/off its activity. For this purpose, metal complexes have been synthesized and preliminary studies in vivo show that all are capable of inhibiting PTEN. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179683 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179682 Law and the practise of principle in diverse societies Torbisco Casals, Neus Projecte de recerca elaborat a partir d’una estada a la London School of Economics and Political Science, United Kingdom, entre 2007 i 2009. L’objecte principal del projecte ha estat analitzar les implicacions jurídico-polítiques i institucionals d’una teoria de la justícia i la igualtat liberals aplicada a societats multiculturals amb un marcat predomini de la diversitat cultural. L’anàlisi desenvolupa una línia d'investigació interdisciplinar - entre el dret i la teoria política - iniciada en una tesis doctoral sobre multiculturalisme i drets de les minories culturals (UPF, 2000) que va culminar en la publicació de Group Rights as Human Rights (Springer, 2006). La recerca adopta com a punt de partida les conclusions de l'esmentada obra, en especial, la rellevància del reconeixement de drets col•lectius; tanmateix, el tipus de qüestions plantejades, l’enfoc i la metodologia emprades són substancialment diferents. En concret, s'adrecen preguntes específiques sobre el model i aspiracions del constitucionalisme democràtic i el paper del dret en contextos multiculturals. També s’atorga un pes central a la dimensió institucional dels models de gestió de la diversitat que s’analitzen, prioritzant un enfocament comparatiu a partir de l’estudi de controvèrsies concretes. L’objectiu és superar algunes limitacions importants de la literatura actual, com ara la tendència a examinar en abstracte la compatibilitat de determinades demandes amb el constitucionalisme democràtic, sense abordar el funcionament d'estratègies de gestió de la diversitat cultural emprades en contextos concrets. Els treballs producte d'aquest projecte articulen les línies bàsiques d’un model pluralista, basat en principis més que en regles, que desafia els plantejaments dominants actualment. Aquest model es caracteritza pel compromís amb la legitimitat i igualtat comparatives, rebutjant el paternalisme i les visions liberals típiques sobre el paper de la regulació. La presumpció de l’“standing” moral dels grups identitaris és fonamental per tal de considerar-los interlocutors vàlids amb interessos genuïns. També s’argumenta que la integració social en contextos multiculturals no depèn tant de l’eliminació del conflicte sinó, sobre tot, d’una gestió eficient que eviti abusos de poder sistemàtics. El model defensa el rol del dret en la institucionalització del diàleg intercultural, però admet que el diàleg no necessàriament condueix a l’acord o a una estructura reguladora coherent i uniforme. Les aspiracions del ordre jurídic pluralista són més modestes: afavorir la negociació i resolució en cada conflicte, malgrat la persistència de la fragmentació i la provisionalitat dels acords. La manca d'un marc regulador comú esdevé una virtut en la mesura que permet la interacció de diferents subordres; una interacció governada per una multiplicitat de regles no necessàriament harmòniques. Els avantatges i problemes d’aquest model s'analitzen a partir de l'anàlisi de l’estructura fragmentària de l'ordre jurídic internacional i del règim Europeu de drets humans.; Report for the scientific sojourn at the London School of Economics and Political Science, United Kingdom, from 2007 to 2009. The main goal of the project has been to examine the legal, political and institutional implications of a theory of justice and equality applied to liberal multicultural societies with high levels of cultural diversity. The analysis develops a line of interdisciplinary research - between law and political theory - that started in a PhD thesis on multiculturalism and cultural rights of minorities (UPF, 2000) and culminated in the publication of Group Rights as Human Rights ( Springer, 2006).  The research project takes the main conclusions of the aforementioned work as a starting point - specially the relevance of recognising collective rights. Yet the type of issues that are raised as well as the approach and methodology are significantly different. In particular, the research addresses specific questions about the model and aspirations of democratic constitutionalism and the role of law in multicultural contexts. In addition, specific attention is given to institutional dimension of the different models for managing diversity that are examined, focusing especifically on comparative approaches to particular disputes. The aim is to overcome some limitations of the current literature, such as the tendency to consider the compatibility of certain demands with democratic constitutionalism in the abstract, without taking into account how particular strategies for managing real controversies have worked out in specific contexts. The outcome of the project consists of a series of pieces in which I tried to articulate the main lines of a pluralistic model that challenges the prevailing approaches in legal theory. While this model is committed to preserve comparative legitimacy and equality, it rejects both liberal and paternalistic views on the role of regulation. The presumption of equal standing of identity groups is seen as crucial to see them as valid interlocutors with genuine interests. I also argue that social integration in multicultural contexts depends not so much on eliminating conflict but rather on its efficient management, as well as on regulations aimed at preventing systematic abuses of power. The model upholds the role of law in institutionalising intercultural dialogue. Yet dialogue does not necessarily lead to agreement or to a common and consistent regulatory framework. The aspirations of the pluralistic legal order are somehow more modest: to promote negotiation and consensus in the face of particular conflicts rather than lasting agreements. Despite the results in terms of fragmentation of the legal order, the lack of a common regulatory framework is taken as a virtue for it allows the interaction between different legal suborders governed by a multiplicity of rules that are not necessarily harmonic. The advantages and problems of this model are explored through analysing the fragmented structure of the international legal order as well as the European human rights regime. Fri, 01 Jan 2010 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179682 2010-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179681 Estràtegies de gestió per al manteniment de la biodiversitat a la sabana brasilera: control d'especies exòtiques amb foc Oliveras Menor, Immaculada Report for the scientific sojourn at the Instituto de Biociências, of the Universidade de Sao Paulo, Brazil, from 2007 to 2009. African exotic grasses, used as forage crops for cattle, found optimal conditions in Brazilian savannas for their spread. They established as invasive grasses in almost all conservation units, becoming a serius threat to native biote and to most ecological processes. Fire is a cyclical event in Brazilian savannas and can be used as a management tool for enhancing competitivity of native grasses and controlling exotic grasses. Seeking for alternatives for the management of these grasses, this study investigates the effect of recurrent burnings in different periods of the year (fire regimes) on: distribution patterns of exotic grasses and their associations wotih native grasses, the local edaphic characteristics, the nutrient pool of the aerial biomass of both native and exotic grasses, and soil seed banks. This project is held on the IBGE Ecological Reserve, in Brasília (Brazil), in an area destined specifically for research of fire effects on brazilian savannas. The project quantifies: aerial biomass of native and exotic grasses, soil seed bank of exotic grasses, nutrient pool in soil and also in grasses tissues. Spatial relationships for any association between species, as well as for nutrient pools in soil and in plant tissues will be established. A better understanding of these processes will provide useful tools for adopting specific policies on the management of exotic grasses in Brazilian savanna. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179681 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179680 Disseny i optimització de membranes compòsit amb xarxes metal•loorgàniques per a nanofiltració i separacions de gasos Cano Odena, Angels Projecte de recerca elaborat a partir d’una estada a la Katholieke Universiteit Leuven, Belgium, entre 2007 i 2009. Aquest projecte descriu la síntesi i aplicació de nous tipus de membranes compòsit basades en xarxes metal•loorgàniques (MOFs). Aquestes es van seleccionar tenint en compte les seves propietats estructurals per tal de discriminar les espècies a separar en funció de la seva mida molecular. Les membranes obtingudes s'han aplicat satisfactòriament tant en separacions líquides, concretament en nanofiltració resistent a dissolvents (SRNF), i en separació de parells de gasos com CO2/CH4, CO2/N2 i H2/CO2. Els resultats obtinguts posen de manifest l'obtenció de membranes sense defectes i amb rendiments prometedors, en la majoria dels casos, amb permeabilitats i selectivitats superiors a membranes purament polimèriques. Tanmateix s'ha desenvolupat un nou equipament d'alt rendiment (HT) per a separacions de gasos que inclou un mòdul que permet realitzar 16 experiments simultàniament. Els resultats obtinguts amb el nou equip són comparables amb els obtinguts amb mòduls convencionals, i alhora presenten una millor reproduïbilitat. Finalment, s'ha establert un nou mètode per a obtenir membranes per a SRNF, que han estat aplicades en processos de separació de catalitzadors homogenis en dissolvents polars apròtics i s'han caracteritzat emprant la tècnica d'espectroscòpia d'annihilació de positrons, que ha permès establir per primer cop una relació entre les propietats estructurals de les membranes a nivell molecular i el seu rendiment en les aplicacions anteriors.; Report for the scientific sojourn at the Katholieke Universiteit Leuven, Belgium, from 2007 to 2009. This project describes the synthesis and application of new type of mixed matrix membranes mostly based on metal organic frameworks (MOFs). The MOF selection was carried out considering their structural features to achieve the separation of the molecules as a function of their size. The obtained membranes have been successfully applied in liquid separations, in particular Solvent Resistant Nanofiltration (SRNF), and also in gas separations of the following gas pairs: CO2/CH4, CO2/N2 and H2/CO2. The obtained results in both cases confirm the preparation of defect-free membranes with promising performances, in most of the cases, superior permeabilities and selectivities than pure polymeric membranes. Moreover, a new High Throughput (HT) set-up for gas separations has been developed, including a membrane module that allows 16 simultaneous experiments. Results are in agreement with the obtained with conventional single cells and also present a better reproducibility. Finally a new cross-linking method to obtain SRNF membranes has been established. These SRNF membranes have been applied to separate homogeneous catalysts in polar aprotic solvents and have been characterized with positron Annihilation Spectroscopy, which has permitted for first time to link the structural properties of the membranes at the molecular level with their performance in the latter applications. Thu, 01 Jan 2009 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179680 2009-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179678 Les "grans negociacions" a la Unió Europea: la formació de preferències, les estratègies y l’èxit a les negociacions Mateo González, Gemma Projecte de recerca elaborat a partir d’una estada a la School of politics and international relations, de la University College of Dublin, United Kingdom, entre 2007 i 2009. L’ objectiu del projecte present ha estat contribuir a l’estudi de les negociacions intergovernamentals a la Unió Europea (UE). En primer lloc, s’ha estudiat les estratègies de negociació del estats membres a negociacions intergovernamentals en la UE, per la qual cosa s’ha desenvolupat una tipologia d’estratègies de negociació, diferenciant entre les més agressives (conflictives) i les menys agressives (cooperatives). La conclusió principal ha estat que els actors difereixen en la elecció de les estratègies i que és precisament el poder relatiu dels actors que explica quines estratègies adopten. En segon lloc, s’analitza la ratificació dels resultats a les negociacions intergovernamentals, concentrant-me en l’us dels referèndums. La investigació mostra que els referèndums són sovint usats pels partits polítics com un instrument utilitzat durant les campanyes electorals, posant en dubte la tesis de que l’objectiu principal dels referèndums és influenciar els poder relatiu dels estats membres en negociacions intergovernamentals. Finalment, s’ha estudiat com els actors socials influeixen aquestes negociacions en la UE. La evidencia empírica clarament mostra que la pressió que exerceixen els grups de pressió es sovint subestimada.; Report for the scientific sojourn at the School of politics and international relations, of the University College of Dublin, United Kingdom, from 2007 to 2009. The main aim of the current project was to contribute to the analysis of intergovernmental negotiations in the European Union (EU). First, it has studied the negotiation strategies of member states in intergovernmental negotiations in the EU, for which it were developed a typology of negotiation strategies, distinguishing between hard (conflictive) and soft (cooperative) bargaining. The main conclusion was that actors differ in their choice of strategies, with an actor’s relative power in the negotiations explaining which strategy it adopts. Secondly, it were analysed the ratification of the outcomes of intergovernmental negotiations, focusing on the use of referenda. The research showed that referenda are often used as a tool in the electoral competition between political parties, casting doubt on claims that the main purpose of referenda is to influence member states’ relative power in intergovernmental negotiations. Finally, it has been studied the role of societal actors in influencing these negotiations in the EU. The empirical evidence clearly shows that the extent of lobbying done by societal actors on EU matters is often underestimated. Thu, 01 Jan 2009 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179678 2009-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179665 Bioinformàtica de ARNs: simulacions d'evolució de viroids i xarxes de molècules de ARN Munteanu, Andreea L'objectiu pràctic principal d'aquest projecte va consistir en la construcció d'un codi informàtic destinat a efectuar simulacions de poblacions de molècules de ARN que es repliquen i evolucionen en el temps. Encara que el projecte es va dirigir cap a la investigació de la interacció entre els viroids i els mecanismes de defensa de la planta, els resultats finals del treball efectuat ens van conduir a conclusions aplicables a l'escala del genoma sencer i no només als viroids o ARNs. En aquest estudi es van analitzar, en l’àmbit de la genètica de poblacions, les conseqüències de la selecció natural endarrerida. Estudis clàssics de la evolució en aquest àmbit han considerat que un individu genera fills en proporció amb la seva superioritat reproductiva (o fitness), un procés en que es poden produir mutacions. L'adquisició de mutacions que produeixen en el individu una fitness molt baixa (mutacions deletèries) impliquen l'impossibilitat de reproducció. En la hipòtesi de selecció endarrerida, els individus que adquireixen mutacions deletèries encara es poden reproduir amb normalitat unes quantes generacions. Durant aquest retard o "compte enrere", els danys transmesos als fills podrien ser reparats mitjançant ulteriors mutacions compensatòries. En l'absència d'aquest tipus de mutacions compensatòries, el fill esdevé estèril i per tant no es podrà reproduir. En aquest treball s’ha estudiat les conseqüències genètiques al nivell poblacional d'aquest retard mitjançant simulacions numèriques i modelitzacions teòriques. Els resultats mostren que la selecció amb retard abaixa el llindar d'error (error threshold), posant en perill la supervivència de la població. De l'altra banda, sorprenentment, aquest retard no deixa cap traça al nivell de la diversitat de les seqüències genòmiques en la població. Aquestes conclusions suggereixen que la selecció endarrerida és difícilment detectada en les dades genètiques i per tant, podria ser un fenomen comú però rarament detectat. Thu, 01 Jan 2009 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179665 2009-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179663 Sistemes de crèdit hipotecari en l'europa del segle XIX, en especial a Catalunya i Espanya: legislació hipotecària i bancs hipotecaris Ribalta Haro, Jaume Investigación producida a partir de una estancia en la Westfälische Wilhelms-Universität, Alemania, entre julio y septiembre del 2007. En este trabajo, se estudia la situación del crédito hipotecario en España a mediados de siglo XIX (con especial atención a Cataluña). En su desarrollo, se abordan tres cuestiones. La situación del crédito hipotecario en España a mediados de siglo XIX. La legislación hipotecaria española en el siglo XIX. En especial, se ha puesto de relieve su incapacidad para movilizar la riqueza inmueble, que sólo se solucionó con una completa reforma hipotecaria y registral. El “sistema de crédito territorial” que, ideado por el desconocido abogado catalán Joaquín Borrell y Vilá, debe considerarse como el verdadero primer paso jurídico hacia el futuro desarrollo de las instituciones de crédito hipotecario en España, aunque fue ignorado por el Gobierno y los agentes económicos.; Report for the scientific sojourn carried out at the Westfälische Wilhelms-Universität, Germany, from july until september 2007. The paper addresses the situation of mortgages in Spain in the mid-nineteenth century (with emphasis on Catalonia). It deals with three issues. The status of mortgage credit in Spain in the mid-nineteenth century. The Spanish mortgage Laws in the nineteenth century. Special attention is paid to its inadequacy for purposes of real estate mobilization, which would end-up with a huge Land Register reform. The “system of mortgage credit”, invented by the unknown catalan lawyer Joaquim Borrell y Vilá. It has to be considered the very first legal step for future development of mortgage credit institutions in Spain, although it was ignored by the Governement and the economic agents. Thu, 01 Jan 2009 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179663 2009-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179658 Forces de Casimir i les seves aplicacions Elizalde, E. (Emili), 1950- Report for the scientific sojourn carried out at the Darmouth College, from august 2007 until february 2008. It has been very successful, from different viewpoints: scientific, philosophical, human. We have definitely advanced, during the past six months, towards the comprehension of the behaviour of the fluctuations of the quantum vacuum in the presence of boundaries, moving and non-moving, and also in situations where the topology of space-time changes: the dynamical Casimir effect, regularization problems, particle creation statistics, according to different BC, etc. We have solved some longstanding problems and got in this subject quite remarkable results (as we will explain in more detail below). We also pursued a general approach towards a viable modified f(R) gravity in both the Jordan and the Einstein frames (which are known to be mathematically equivalent, but physically not so). A class of exponential, realistic modified gravities has been introduced by us and investigated with care. Special focus was made on step-class models, most promising from the phenomenological viewpoint and which provide a natural way to classify all viable modified gravities. One- and two-steps models were considered, but the analysis is extensible to N-step models. Both inflation in the early universe and the onset of recent accelerated expansion arise in these models in a natural, unified way, what makes them very promising. Moreover, it is monstrated in our work that models in this category easily pass all local tests, including stability of spherical body solution, non-violation of Newton's law, and generation of a very heavy positive mass for the additional scalar degree of freedom. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179658 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179655 Organizational form and business performance Grifell i Tatjé, Emili This project deals with the generation of profitability and the distribution of its benefits. Inspired by Davis (1947, 1955), we define profitability as the ratio of revenue to cost. Profitability is not as popular a measure of business financial performance as profit, the difference between revenue and cost. Regardless of its popularity, however, profitability is surely a useful financial performance measure. Our primary objective in this project is to identify the factors that generate change in profitability. One set of factors, which we refer to as sources, consists of changes in quantities and prices of outputs and inputs. Individual quantity changes aggregate to the overall impact of quantity change on profitability change, which we call productivity change. Individual price changes aggregate to the overall impact of price change on profitability change, which we call price recovery change. In this framework profitability change consists exclusively of productivity change and price recovery change. A second set of factors, which we refer to as drivers, consists of phenomena such as technical change, change in the efficiency of resource allocation, and the impact of economies of scale. The ability of management to harness these factors drives productivity change, which is one component of profitability change. Thus the term sources refers to quantities and prices of individual outputs and inputs, whose changes influence productivity change or price recovery change, either of which influences profitability change. The term drivers refers to phenomena related to technology and management that influence productivity change (but not price recovery change), and hence profitability change. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179655 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179652 Problemes derivats de la incidència de les normes europees en el Dret penal dels Estats membres Pastor Muñoz, Núria Projecte de recerca elaborat a partir d’una estada al Universitat de Bonn, Alemanya, entre juliol i desembre del 2008. Aquesta investigació conté algunes observacions sobre el fenomen de l’europeització del Dret penal dels Estats membres de la Unió Europea. En particular, tracta de profunditzar en les implicacions de la vinculació del legislador penal nacional tant a les regulacions europees com al principi de proporcionalitat i d’altres principis essencials del Dret penal. En primer lloc, la investigació descriu els instruments normatius que permeten a la Comunitat Europea i a la Unió Europea influir en el Dret penal dels Estats membres. Després, la investigació se centra en analitzar el exemple dels §§ 232 i 233 Codi penal alemany, els quals implementen la Decisió marc de 19 de juliol del 2002 respecte la lluita contra el tràfic d’éssers humans. En aquest cas, el legislador alemany ha complit els seus compromisos europeus, però no ha respectat el principi de proporcionalitat, ja que ha introduït incoherències dins el Dret penal alemany. Sobre la base dels resultats d’aquest anàlisi, aquesta investigació formula algunes propostes per una adequada “europeització” del Dret penal dels Estats membres de la Unió Europea i, en particular, per a una adequada tècnica legislativa dels Estats membres. En aquest context, el treball emfatitza la corresponsabilitat de la Comunitat Europea i la Unió Europea, per una banda, i els Estats membres, per l’altra, en aquest procés d’europeització. Per últim, la investigació conclou amb algunes observacions sobre la coordinació de la política criminal europea amb les polítiques criminals dels Estats membres.; Report for the scientific sojourn carried out at the University of Bonn, Germany, from july until december 2008. This investigation contents some observations about the phenomenon of the Europeisation of the Criminal Law of the Member States of the European Union. In particular it goes deeply into the implications of the bond of the national legislator to respect both the European regulations and the principle of proportionality as well as further fundamental principles of the Criminal Law. First of all this work describes the normative instruments that allow the European Community and the European Union to influence the Criminal Law of the Member States. Afterwards it analyses the example of the §§ 232, 233 of the German Penal Code, which implement the Council Framework Decision of 19 July 2002 on combating trafficking in human beings. In this case, the German legislator has fulfil its European compromises, but has not respected the principle of proportionality, because it has introduced inconsistencies in the German Criminal Law: this example is therefore a case of unsatisfactory implementation of European regulations. On the basis of the results of this analysis, this investigation formulates some proposals for an adequate „Europeisation” of the Criminal Law of the Member States of the European Union and in particular for an adequate methodology of the legislation of the Member States. In this context, the work emphasizes the co-responsibility of the European Community and European Union on the one hand and the Member States on the other hand for this Europeisation process. Finally the work concludes with some observations about the coordination of European and national Criminal Law Policy. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179652 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179648 Papel de la Interleucina 6 (IL-6) en la regulación de la expresión de Osteopontina (OPN) y CD44 tras axotomía del nervio facial Castellano López, Bernardo Investigación producida a partir de una estancia en la University of Sidney, Australia, entre octubre del 2008 y enero del 2009. Se ha desarrollado el proyecto titulado "Papel de la interleucina 6 (IL6) en la regulación de la expresión de Osteopontina (OPN) y de CD44 tras axotomía del nervio facial". Tras efectuar una transección del nervio facial, se indujo una reactividad glial en el núcleo facial (NF) localizado en el tronco cerebral, utilizando ratones transgénicos que sobrexpresan IL6 bajo promotor GFAP (tg GFAP-IL6), es decir selectivamente en astrocitos. Se han utilizado técnicas histoquímicas e inmunohistoquímicas, así como también se ha completado el estudio utilizando análisis de RPA, western blotting y citometría de flujo para la identificación de poblaciones celulares. Los resultados obtenidos indican que la OPN se expresa constitutivamente en las neuronas del NF. Tras axotomía del nervio facial, la expresión de OPN y CD44 incrementa en los ratones WT, mientras que en los tg GFAP-IL6 disminuye significativamente, sugiriendo que la IL6 podría estar involucrada en la modulación de la expresión de ambas moléculas. Sin embargo, no se ha visto diferencias en otros receptores de OPN como la integrina Alpha-5. La ctometría de flujo corroboró algunos de los resultados histológicos sobre la reactividad microglial y permitió concluir que la proporción de microglía activada (CD11b+/CD45+mid) y macrófagos (CD11b+/CD45+high) que expresan CD44 incrementa en in los tg GFAP-IL6 versus WT donde la mayor parte de microglia activada mostraba un perfil CD11b+/CD45+low.; Report for the scientific sojourn carried out at the Faculty of Sciences of the University of Sidney, Austràlia, from october 2008 until january 2009. It has been developed the project entitled: "Role of Interleukin 6 (IL6) in the regulation of Osteopontin (OPN) and CD44 expression after facial nerve axotomy". It was induced a glial reaction in the facial nucleus (FN) located in the brainstem, after facial nerve axotomy (FNA), in transgenic mice that overexpress IL6 under GFAP promotor (tg GFAP-IL6), that is to say IL6 is targeted to astrocytes. We have used histochemical and immunohistochemical techniques and addtionally Ribonuclease Protein Assay for RNAm analyisis, western blotting for protein analysis and flow citometry for cell population identification. The results obtained indicate that OPN is constitutively expressed in motorneurons of the FN. After FNA, OPN and CD44 expression increased in the WT, whereas in tg GFAP-IL6, it has been found a significative decrease, sugesting that IL6 may be involved in the modulation of both molecules. However, other OPN receptors like Alpha5 integrin do not decrease in axotomized tg GFAP-IL6 mice. Flow citometry analysis corroborate some of the histological observations on microglial reactivity associated to FNA, showing that the proportion of activated microglia (CD11b+/CD45+mid) and macrophages (CD11b+/CD45+high) expressing CD44 in the lesioned FN are increased in tg GFAP-IL6 versus WT where major part of reactive microglia showed a CD11b+/CD45+low profile Thu, 01 Jan 2009 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179648 2009-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179645 Canvi tecnològic i desenvolupament econòmic durant la segona revolució industrial: la transferència tecnològica del sector tèxtil entre Anglaterra i Catalunya       Llonch, Montserrat Projecte de recerca elaborat a partir d’una estada a la University of Sussex, Gran Bretanya, entre març i juliol del 2008. L’estada ha estat centrada en obtenir fonts documentals primàries, per avançar en el projecte d’investigació sobre la transferència de tecnologia entre Catalunya i Anglaterra durant la Segona Revolució Industrial. Això ha estat possible gràcies a la consulta de les patents britàniques (Business & Intellectual Property Centre at the British Library). Així mateix, l’obtenció dels recursos documentals especialitzats de diverses biblioteques de referència situades al campus de la University of Sussex (Keith Pavitt Libray (SPRU), Library of Sussex, British Library of Development Studies) i a Ruddignton Framework Knitters’ Library a Nottingham han estat fonamentals, tal i com es pot veure en la relació detallada que es presenta.; Report for the scientific sojourn at the University of Sussex, United Kingdom, from september until july 2007. The research stay at the University of Sussex was focused to obtain primary documental sources in order to develop a research project about the technology transfer between Catalonia and England during the Second Industrial Revolution. For this reason, extensively, the Business & Intellectual Property Centre at the British Library were consulted and, likewise, it was obtained specialized documental sources from diverse campus libraries at the University of Sussex (Keith Pavitt Libray (SPRU), Library of Sussex, British Library of Development Studies) and the Ruddignton Framework Knitters' Library in Nottingham. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179645 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179642 Cirp function and characterisation in RNA and microRNAs Lleonart Pajarin, Matilde Esther In order to search for novel genes involved in cell proliferation, the hypothesis was that by infecting primary cells with a cDNA library of immortal cells would render immortalizing genes. Consequently it has been discovered CIRP (Cold inducible RNA-binding protein). Mammalian cells exposed to mild hypothermia show a general inhibition of protein synthesis and a concomitant increase in the expression of a small number of cold-shock mRNAs and proteins. Rbm3, another RNA binding protein belonging to the same family, has been postulated to facilitate protein synthesis at mild cold shock. To investigate if the same occurs for CIRP, CIRP was overexpressed in primary cells and protein sintesis was measured. Interestingly, CIRP increased protein synthesis, however, such increase did not involve an increase in the polysome fraction or affected the ribosome profile. In addition, the effect caused by CIRP inhibition or knockdown was also analyzed. Different siRNAs against CIRP were tested. Once checked their efficiency by decreasing CIRP at mRNA and protein levels, proliferation was tested by BrdU, cell number (DAPI) and proliferation curves were performed. Interestingly, CIRP provoke a decreased proliferation in primary cells: MEFs, HMEC; and cancer cells: TERA2 and HeLa. In conclusion, we describe for the first time that CIRP bypasses replicative senescence when over-expressed at physiological temperature (37ºC) by increasing a general protein synthesis. This effect is achieved through ERK1/2 activation in MEFs.The decrease in growth rate found in mammalian cells treated with mild cold stress is not entirely attributable to arrested metabolism. This decrease may also involve an active process in which CIRP and other stress-responsive proteins play a fundamental role in stimulating proliferation. Although most cell proteins are down-regulated or inhibited with cold stress, CIRP is activated to maintain cells in an active proliferative status and its overexpression at 37°C might be potentially oncogenic. Thu, 01 Jan 2009 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179642 2009-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179639 Telomere characterization in the Asteraceae family Garnatje i Roca, Teresa Asteraceae or Compositae constitute one of the largest families of the angiosperms, distributed over all continents but in Antarctica, particularly well represented in temperate zones and less frequent in tropical regions. The Asteraceae have been the object of a great deal of attention from all viewpoints for their scientific as well as economic interest. Telomeres sequences are highly conservated at the ends of chromosomes across the eukaryotes. In plants, generally are formed by tandemly repeated sequences named Arabidopsis type but several exceptions have been described. The objective of the present work is to study the telomeric characterization along the whole Asteraceae family and to find, if any, the relationships between these results and the evolutionary history in this family.; Les asteràcies o compostes constitueixen una de les famílies més grans de les angiospermes, amb una distribució que inclou tots els continents amb l’excepció de l’Antàrtida, especialment ben representada en les zones temperades i menys freqüent en les regions tropicals. Les asteràcies han estat objecte d’estudi des de molts punts de vista atesa la seva importància científica i també econòmica. Les seqüències telomèriques es troben altament conservades en els extrems dels cromosomes dels eucariotes. En plantes, generalment estan formats per seqüències repetides en tàndem del tipus Arabidopsis, tot i que existeixen força excepcions. L’objectiu del present treball és caracteritzar les regions telomèriques en la família i trobar, si existeixen, les relacions entre aquests resultats i la història evolutiva en aquesta família. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179639 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179633 Detecció i localització d'impactes a estructures aeroespacials Mujica Delgado, Luis Eduardo Projecte de recerca elaborat a partir d’una estada a la Universidad Politécnica de Madrid, Espanya, entre setembre i o desembre del 2007. Actualment la indústria aeroespacial i aeronàutica té com prioritat millorar la fiabilitat de las seves estructures a través del desenvolupament de nous sistemes per a la monitorització i detecció d’impactes. Hi ha diverses tècniques potencialment útils, i la seva aplicabilitat en una situació particular depèn críticament de la mida del defecte que permet l’estructura. Qualsevol defecte canviarà la resposta vibratòria de l’element estructural, així com el transitori de l’ona que es propaga per l’estructura elàstica. Correlacionar aquests canvis, que poden ser detectats experimentalment amb l’ocurrència del defecte, la seva localització i quantificació, és un problema molt complex. Aquest treball explora l’ús de l'Anàlisis de Components Principals (Principal Component Analysis - PCA-) basat en la formulació dels estadístics T2 i Q per tal de detectar i distingir els defectes a l'estructura, tot correlacionant els seus canvis a la resposta vibratòria. L’estructura utilitzada per l’estudi és l’ala d’una turbina d’un avió comercial. Aquesta ala s’excita en un extrem utilitzant un vibrador, i a la qual s'han adherit set sensors PZT a la superfície. S'aplica un senyal conegut i s'analitzen les respostes. Es construeix un model PCA utilitzant dades de l’estructura sense defecte. Per tal de provar el model, s'adhereix un tros d’alumini en quatre posicions diferents. Les dades dels assajos de l'estructura amb defecte es projecten sobre el model. Les components principals i les distàncies de Q-residual i T2-Hotelling s'utilitzaran per a l'anàlisi de les incidències. Q-residual indica com de bé s'adiu cadascuna de les mostres al model PCA, ja que és una mesura de la diferència, o residu, entre la mostra i la seva projecció sobre les components principals retingudes en el model. La distància T2-Hotelling és una mesura de la variació de cada mostra dins del model PCA, o el que vindria a ser el mateix, la distància al centre del model PCA.; Report for the scientific sojourn at the Universidad Politécnica de Madrid, Spain, from september until july 2007. Nowadays, the aerospace and aircraft industry has a main priority in improving the reliability of their structures through the development of novel systems for monitoring and damage detections. There are several potentially useful techniques, and their applicability to a particular situation depends on the size of damage critical admissible in the structure. Any damage will change the vibrational response of the structural element, as well as the transient by a wave that is spreading through the elastic structure. Correlating these changes, which can be detected experimentally with the occurrence of damage, and its location and quantification, is a very complex problem. This work explores the use of Principal Component Analysis (PCA) based on T2 and Q statistic formulation to detect and distinguish damages in structures, correlating its vibrational response changes. The structure used for this study is a blade of a turbine of an aircraft. This blade is excited using a shaker in one side and seven PZT’s sensors are attached on the surface. A known signal is applied and the responses are analyzed. A PCA model is built using data from the undamaged structure. A mass is attached on the surface in four different positions. Data from the damaged structure tests are projected on the model. The principal components, Q-Residual and T2-Hotelling’s distances are analyzed. Qresidual indicates how well each sample conforms to the PCA model. It is a measure of the difference, or residual between a sample and its projection into the principal components retained in the model. T2-Hotelling’s distance, is a measure of the variation in each sample within the PCA model. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179633 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179632 Processament de música basat en el seu contingut Ramirez Melendez, Rafael Projecte de recerca elaborat a partir d’una estada a la National University of Singapore Singapur, entre juliol i octubre del 2007. Donada l'explosió de la música a l'internet i la ràpida expansió de les col•leccions de música digital, un repte clau en l'àrea de la informació musical és el desenvolupament de sistemes de processament musical eficients i confiables. L'objectiu de la investigació proposada ha estat treballar en diferents aspectes de l'extracció, modelatge i processat del contingut musical. En particular, s’ha treballat en l'extracció, l'anàlisi i la manipulació de descriptors d'àudio de baix nivell, el modelatge de processos musicals, l'estudi i desenvolupament de tècniques d'aprenentatge automàtic per a processar àudio, i la identificació i extracció d'atributs musicals d'alt nivell. S’han revisat i millorat alguns components d'anàlisis d'àudio i revisat components per a l'extracció de descriptors inter-nota i intra-nota en enregistraments monofónics d'àudio. S’ha aplicat treball previ en Tempo a la formalització de diferents tasques musicals. Finalment, s’ha investigat el processat d'alt nivell de música basandonos en el seu contingut. Com exemple d'això, s’ha investigat com músics professionals expressen i comuniquen la seva interpretació del contingut musical i emocional de peces musicals, i hem usat aquesta informació per a identificar automàticament intèrprets. S’han estudiat les desviacions en paràmetres com to, temps, amplitud i timbre a nivell inter-nota i intra-nota.; Report for the scientific sojourn at the National University of Singapore, Singapore, from july until october 2007.A key challenge in the area of music information, given the explosion of online music and the rapidly expanding digital music collections, is the development of efficient and reliable music processing systems. The objective of the proposed research has been to work on different aspects of the extraction, modelling and processing of musical content. In particular, we worked on the extraction, analysis and manipulation of low-level audio descriptors, the modeling of musical processes, the study and development of machine learning techniques for processing audio, and the identification and computation of high-level semantic musical attributes. It has been revised and improved some audio analysis components and refined components for the extraction of both inter-note and intra-note descriptors in monophonic music audio recordings. It has been applied previous work on Tempo to the formalization of different musical tasks, e.g. musical processes. Finally, it has been investigated high-level content-based music processing in the context of monophonic audio recordings. As an instance of this last point, it has been investigated how skilled musicians express and communicate their view of the musical and emotional content of musical pieces and how to use this information in order to automatically identify performers. It has been studied deviations of parameters such as pitch, timing, amplitude and timbre both at an inter-note level and at an intra-note level. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179632 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179615 Regulatory federalism in network industries Trillas Jané, Francesc Report for the scientific sojourn at the UC Berkeley, USA, from march until july 2008. This document starts by surveying the literature on economic federalism and relating it to network industries. The insights and some new developments (which focus on the role of interjurisdictional externalities, multiple objectives and investment incentives) are used to analyze regulatory arrangements in telecommunications and energy in the EU and the US. In the long history of vertically integrated monopolies in telecommunications and energy, there was a historical trend to move regulation up in the vertical structure of government, at least form the local level to the state or nation-state level. This move alleviated the pressure on regulators to renege on the commitment not to expropriate sunk investments, although it did not eliminate the practice of taxation by regulation that was the result of multiple interest group action. Although central or federal policy making is more focused and especialized and makes it difficult for more interest groups to organize, it is not clear that under all conditions central powers will not be associated with underinvestment. When technology makes the introduction of competition in some segments possible, the possibilities for organizing the institutional architechture of regulation expand. The central level may focus on structural regulation and the location of behavioral regulation of the remaining monopolists may be resolved in a cooperative way or concentrated at the level where the relevant spillovers are internalized. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179615 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179598 Efecte de l'estrès estructual sobre l'emissió estimulada (laseig) en capes epitaxials de KY0.8Yb0.2(WO4)2 i KLu0.8Yb0.2(WO4)2 crescudes sobre substractes de KY(WO4)2 i KLu(WO4)2 Carvajal Martí, Joan Josep Projecte de recerca elaborat a partir d’una estada a la State University of New York a Stony Brook, EEUU, a l’agost i setembre del 2008. S’ha demostrat com està relacionada la diferència en el rendiment de lasejat de dos mostres altament dopades amb iterbi (20 at. %) de capes epitaxials de KY(WO4)2 (KYW) dopat amb Yb crescut sobre un substrat de KYW i de KLu(WO4)2 (KLuW) dopat amb Yb crescut sobre un substrat de KLuW, respectivament, amb la presència de estrès estructural en les capes epitaxials, investigat per Topografia de Feix Blanc de Raig X de Sincrotró. A partir dels resultats obtinguts, queda clar que les mostres que mostren una quantitat d'estrés estructural més gran, les epitaxies de KYW dopat amb Yb crescudes sobre substrats de KYW, duen a una eficiència més petita durant el lasejat, permetent establir una correlació directa entre l'existència i la magnitud d'aquest estrès estructural i la pèrdua del rendiment làser en aquestes capes epitaxial, que per altra banda, des del punt de vista espectroscòpic són equivalents.; Report for the scientific sojourn at the State University of New York at Stony Brook, USA, on august and september 2008.It has been demonstrated how the difference in laser performance of two highly doped (20 at %) epitaxial layers of Yb-doped KY(WO4)2 (KYW) grown on a KYW substrate and Yb-doped KLu(WO4)2 (KLuW) grown on a KLuW substrate, respectively, is related to the presence of structural stress in the epilayers, investigated by Synchrotron White Beam X-ray Topography. From the results obtained it is clear that the samples that show a larger amount of structural stress, Yb:KYW/KYW epitaxies, lead to lower efficiency in laser operation, giving a direct correlation between the existence and magnitude of such structural stress and the loss in efficiency of laser performance in such epitaxial layers which, from spectroscopical point of view, are otherwise equivalent. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179598 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179353 The nature of the Cr-C bond: direct estimation of aromaticity in Fischer carbenes Jiménez Halla, José Óscar Carlos Report for the scientific sojourn at the the Philipps-Universität Marburg, Germany, from september to december 2007. For the first, we employed the Energy-Decomposition Analysis (EDA) to investigate aromaticity on Fischer carbenes as it is related through all the reaction mechanisms studied in my PhD thesis. This powerful tool, compared with other well-known aromaticity indices in the literature like NICS, is useful not only for quantitative results but also to measure the degree of conjugation or hyperconjugation in molecules. Our results showed for the annelated benzenoid systems studied here, that electron density is more concentrated on the outer rings than in the central one. The strain-induced bond localization plays a major role as a driven force to keep the more substituted ring as the less aromatic. The discussion presented in this work was contrasted at different levels of theory to calibrate the method and ensure the consistency of our results. We think these conclusions can also be extended to arene chemistry for explaining aromaticity and regioselectivity reactions found in those systems.In the second work, we have employed the Turbomole program package and density-functionals of the best performance in the state of art, to explore reaction mechanisms in the noble gas chemistry. Particularly, we were interested in compounds of the form H--Ng--Ng--F (where Ng (Noble Gas) = Ar, Kr and Xe) and we investigated the relative stability of these species. Our quantum chemical calculations predict that the dixenon compound HXeXeF has an activation barrier for decomposition of 11 kcal/mol which should be large enough to identify the molecule in a low-temperature matrix. The other noble gases present lower activation barriers and therefore are more labile and difficult to be observable systems experimentally. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179353 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179350 Determinació de la regió del genoma o gens implicats en la síntesi del polièster extracel•lular present en la variant llisa de Mycobacterium vaccae mitjançant transformació Agustí Adalid, Gemma; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de biociències Estudi realitzat a partir d’una estada a la Universidad de Zaragoza, Espanya, entre novembre del 2007 i abril del 2008. Mycobacterium vaccae és un micobacteri ambiental de creixement ràpid molt estudiat pel seu interès com a possible ús immunoterapéutic en el tractament de la tuberculosis i altres malalties. M.vaccae a l’igual que altres micobacteris presenta dues morfologies colonials: llisa i rugosa. M.vaccae ATCC15483T té originàriament una morfologia llisa. Quant aquest es cultiva en medi sòlid a 30ºC apareixen espontàniament variants rugoses estables que no reverteixen a llises. El motiu pel qual aquest procés té lloc no es coneix, encara que s’ha descrit en Mycobacterium smegmatis i en Mycobacterium avium que els lípids de la paret cel•lular es troben involucrats en aquest canvi de morfologia colonial. L’anàlisi dels contingut en lípids i glicolípids de la paret cel•lular de les dos variants morfològiques de M.vaccae, ens ha indicat que les soques llises presenten un compost extracel•lular que no es troba en les rugoses i que mitjançant l’anàlisi estructural d’aquest compost ha sigut identificat com un polièster extracel•lular de cadena llarga. El present estudi s’ha centrat en determinar els gens implicats en la síntesis d’aquest compost. Per a realitzar aquest anàlisi genètic s’ha construit una llibreria de mutants per transposició de la soca llisa de M. vaccae mitjançant un plàsmid ts/sac i un transposó. S’han obtingut colònies de morfologia rugosa on el plàsmid s’ha insertat en la zona del genoma que codifica per aquest compost extracel•lular. Aquests nous mutants s’han analitzat mitjançant tècniques moleculars (PCR, Southern y seqüenciació). A mès, s’ha construit una llibreria genòmica amb DNA de la soca llisa en plàsmids replicatius de micobacteris derivats de pAL5000 i s’ha transformat la soca rugosa seleccionant per a un fenotip llis estudiant els gens que complementen.; Report for the scientific sojourn at the the Universidad de Zaragoza, Spain, from november 2007 to april 2008. Mycobacterium vaccae is fast growing environmental mycobacteria that has been throughly studied for its possible immunotherapeutic use as adjunctive to the current chemotherapy in tuberculosis and others diseases. M. vaccae displays smooth and rough colony morphologies. M. vaccae 15483 ATTCT displays originally smooth morphology but it spontaneously appears a rough phenotype when it’s cultivated in solid media at 30ºC. It is unknown the reason why this process occurs, although in Mycobacterium smegmatis and Mycobacterium avium have been recently described that the cell wall lipids are involved in the colonial morphology changes. The analysis to the composition of the cell wall in both M. vaccae colonial morphologies has showed that the smooth morphotype presents an extracellular material that has never previously been described and it has been identified as a long-chain saturated polyester. Interestingly this compound is not produced by the rough morphotype. After these studies we aimed to determine the genes involved in its synthesis. To carry out this genetic analysis we constructed a library of mutants from the smooth M. vaccae by transposition, using a ts-sacB vector and a transposon. Using these mutants we obtained rough colony variants in which the transposon was inserted in the genome zone that codify for the extracellular compound. These news mutants were analyzed using molecular tools (PCR, Southern and sequencing). In addition, we constructed a genomic library with the smooth M. vaccae DNA in replicative mycobacterial plasmids and we transformed the rough M. vaccae with this genomic library. Thu, 01 Jan 2009 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179350 2009-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179348 Noves tecnologies per l'estudi de l'arqueologia de Patagònia (Amèrica del Sud) Barcelo Alvarez, Joan The goal of this project was the historical study of Patagonia, the southernmost human settled area of the world. Our aim has been the anlysis of those societies to understand how they maintained their socioeconomic system, that is to say, how social reproduction allowed resolving the basic contradiction between production and reproduction, which is characteristic of all hunter-gatherer societies. New computational technologies have allowed a bettwer integration of the big amount and diversity of data needed. We have analyzed the historical evolution of inter-group and intra-group social relationships among nomad patagonian societies. We have compared different social answers in front of the radical change of their immediate reality produced by european colonization. We have exhaustively analyzed the results of archaeological excavations from diferent regions. We have also integrated information from anthropology, ethnohistory and geography. We are developing computing programs to integrate geographical actual data with paleoenvironmental data about the dynamic nature of soil formation, vegetation, hidrography, etc., with information about the history of productive action and how products were distributed among different human groups.; Aquest projecte tenia per objectiu l’estudi històric i arqueològic de Patagonia, la regió poblada més austral del món. El nostre objectiu ha estat analitzar aquestes societats per a comprendre com van poder mantenir el seu sistema socioeconòmic, és a dir com van poder mantenir-se aquestes societats malgrat la contradicció entre producció i reproducció característica en societats caçadores recol•lectores. Les noves metodologies en informàtica ens han permès una millor integració de la gran diversitat de dades necessàries. Hem volgut analitzar l’evolució històrica de les relacions i interrelacions intragrup i intergrup de les societats nòmades patagòniques, així com comparar les seves diferents respostes davant el canvi radical de realitat immediata que va suposar la colonització. Per aixó hem analitzat exhaustivament els resultats d’excavacions arqueològics de diverses regions i hem integrat la informació provinent d’altres disciplines com l’antropologia, la etnohistoria i la geografia. Estem desenvolupant els programes informàtics que ens permetin integrar dades geogràfiques actuals i paleoambientals de la dinàmica natural de formació dels sòls, de la vegetació i dels recursos hídrics en Patagonia (rius, llacs, valls, altiplans i estepa) amb informació històrica de l’acció productora, transformadora i distribuïdora de les poblacions humanes. La memòria posa de manifest els resultats de la investigació, i no tant les eines utilitzades. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179348 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179347 Evaluación de un nuevo método de sutura para la cirugía endoscopica transluminal a través de orificios naturales en un modelo animal Fernández Esparrach, M. Glòria Natural Orifice Transluminal Endoscopic Surgery (NOTES) is a novel, potentially less invasive alternative to laparoscopic surgery. However, the problems of transluminal access and closure represent significant obstacles to its successful introduction in humans. Objective: to evaluate the feasibility and safety of a novel device designed for transluminal access and closure in a survival porcine model. Subjects: Four adult female Yorkshire pigs were used in the study. Interventions: While under general anesthesia, the animals were prepared with multiple tap water enemas followed by instillation of an antibiotic suspension and povidone-iodine lavage. At a distance of 15 to 20 cm from the anus, the prototype device (LSI Solutions, Victor, NY, USA) deployed a circumscribing purse-string suture around the planned incision site and subsequently used a blade mechanism to create a 2.5-cm linear incision. The transcolonic incision was then closed by cinching and securing the purse-string suture with a titanium knot by use of a separate hand-activated suture-locking device. Main Outcome Measurements: The animals were monitored daily for signs of peritonitis and sepsis and were survived for 14 days. The peritoneal cavity was examined for peritonitis, and the colonic incision site was examined for wound dehiscence, pericolic abscess formation, and gross adhesions. Tissue samples from both incisional and random peritoneal sites were obtained for histologic examination. Results: Transcolonic incision and closure were successful in all 4 animals. The device performed in a rapid and reproducible fashion. All animals recovered without septic complications. At necropsy, there was no evidence of peritonitis, abscesses, or wound dehiscence. Salpingocolonic and colovesicular adhesions were noted in 3 of 4 animals. Histologic examination revealed microabscesses at the incision site in all animals. Conclusions: The prototype incision and closure device represents a promising solution to the problems of transluminal access for NOTES. The presence of incision-related adhesions and microabscesses signal the need for further refinement in aseptic technique.  Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179347 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179307 Estructura de la justificació epistèmica López, Mireia Estudi realitzat a partir d’una estada a la Uniersity de Sheffield, Gran Bretanya, entre octubre del 2007 i febrer del 2008. El treball ha estat centrat en el debat entre liberals i conservadors sobre l’estructura de la justificació perceptiva. Avuí en dia hi ha molts filòsofs que retornen al dogmatisme del sentit comú proclamat per G.E. Moore i la seva Prova sobre el Món Extern: I-Hi ha alguna cosa que sembla una mà; II-Hi ha una mà; III-Hi ha un món extern. És àmpliament acceptat que aquesta prova no constitueix una resposta satisfactòria a l’escepticisme sobre el nostre dret a dir que sabem, però quan es tracta de caracteritzar per què no és satisfactòria hi ha desacord. Això ha dut a encetar el debat entre liberals i conservadors pel qu fa a l’estructura de la justificació perceptiva. Mon, 09 Jun 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/179307 2008-06-09T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/16011 L'anoditzat d'alumini com a eina per a la fabricació de nanomaterials 1D Montero Moreno, Josep M El projecte se centra en la fabricació de nanomaterials 1D mitjançant una estratègia sintètica, basada en la combinació de metodologies top-down i bottom-up: la deposició de materials diversos a l’interior de l’estructura porosa de l’alúmina anòdica. En una primera etapa del treball, es desenvolupa el procés de fabricació de les membranes poroses, conegut com anoditzat de l’alumini. S’analitzen diversos aspectes del procés per tal d’optimitzar-lo i aconseguir la fabricació de capes poroses d’elevada qualitat de manera controlada, reproduïble i utilitzant un alumini de baixa puresa. Posteriorment, s’avalua la versatilitat de les membranes com a plantilla per a l’obtenció de nanomaterials amb geometria 1D (nanofils i nanotubs) mitjançant tècniques diverses. D’una banda es fabriquen nanofils de níquel magnètics mitjançant tècniques electroquímiques de deposició, amb la novetat que la formació del dipòsit té lloc directament a través del sistema alumini – alúmina. D’altra banda, s’obtenen nanotubs d’òxid de ferro magnètic (Fe3O4) mitjançant la tècnica de deposició per capes atòmiques. Les dues tècniques permeten un alt control de tots els paràmetres estructurals. Finalment, s’inclou un estudi sobre la preparació de membranes poroses d’alúmina anòdica avançades. La principal característica d’aquestes membranes és la modulació a voluntat del diàmetre de porus, resultant en pseudo-nanoestructures 1D. Thu, 01 Jan 2009 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/16011 2009-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/15536 Estudio de la patogenia de clostridium perfringens tipo b y d en pequeños rumiantes Martínez Martínez, Jorge Proyecto de investigación realizado a partir de una estancia en la University of California, Davis, Estados Unidos, entre octubre y desembre del 2007. Clostridium perfringens (C. perfringens) tipo C causa enteritis necrotizante en humanos y enterotoxemias en animales domésticos. Esta bacteria produce beta toxina (CPB), alfa toxina (CPA) y perfringolisina (PFO) durante la fase logarítimca de crecimiento. En nuestro estudio se evaluó la relación entre CPB y la virulencia del aislamiento CN3685 de Cl. perfringens tipo C en un modelo caprino con inoculación intraduodenal. De manera similar a la infección natural por C. perfringens tipo C, el cultivo vegetativo del tipo salvaje de CN3685 provocó dolor abdominal, diarrea hemorrágica, enteritis necrotizante, colitis, edema pulmonar, hidropericardio y muerte en 2 cabritos, a las 24 horas postinoculación. Por otro lado, mediante tecnología Targe Tron® se prepararon mutantes isogénicos carentes de toxina CPB, los cuales fueron inoculados siguiendo el modelo anteriormente descrito. Los resultados mostraron que estos mutantes carecían de todo tipo de virulencia, ya que no se observaron signos clínicos durante las primeras 24 h postinoculación ni tampoco lesiones macroscópicas ni histopatológicas. Posteriormente se desarrolló un modelo experimental similar a los anteriores, en los que se había repuesto la capacidad de producción de CPB en los mutantes. Los dos animales inoculados con estos mutantes complementarios presentaron signos clínicos y lesiones similares a las observadas en el caso del tipo salvaje. Estos resultados muestran que la toxina CPB es necesaria y suficiente para inducir la enfermedad causada por CN3685. Esto a su vez, demuestra la importancia de este tipo de toxina en la patogénesis de C. perfringems tìpo C.; Report for the scientific sojourn carried out at the University of California, Davis, United States, from October until December 2007. Clostridium perfringens type C isolates, which cause enteritis necroticans in humans and enterotoxemias of domestic animals, typically produce (at minimum) beta toxin (CPB), alpha toxin (CPA) and perfringolysin O (PFO) during log-phase growth. We evaluated the contribution of CPB to the virulence of type C isolate CN3685 in an intraduodenal challenge model in goats. Similar to natural type C infection, late log-phase vegetative culture of wild-type CN3685 caused abdominal pain, hemorrhagic diarrhea, necrotizing enteritis and colitis, pulmonary edema, hydropericardium and death in 2 goats within 24 h of inoculation. Isogenic CPB toxin null mutants were prepared using TargeTron® technology. These mutants were completely devoid of virulence in this animal model; 2 goats inoculated with the null mutants remained clinically healthy during 24 h after inoculation and no gross or histological abnormalities were observed in the tissues of either animal, after euthanasia and post-mortem examination. Complementation of a cpb mutant restored its CPB production and virulence; 2 goats inoculated with these complemented mutants presented clinical and pathological changes similar to those observed in goats inoculated with the wild type strain. These results indicate that CPB is both required and sufficient for CN3685-induced disease, supporting a key role for this toxin in type C disease pathogenesis. Tue, 01 Jan 2008 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/15536 2008-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/15535 Relació entre fotosíntesi i respiració en cultius sotmesos a estrés hídric mitjançant isòtops estables Nogués Mestres, Salvador Report for the scientific sojourn carried out at the Universite Paris Sud – XI, France, from July until october 2007. The relationship between photosynthesis and respiration were studied in crops using carbon and nitrogen stable isotopes under well watered and water-stressed conditions. The analyses of the 13C isotopic composition (δ13C) of total organic matter (TOM) recently fixed of well-watered plants revealed that it was mainly delivered to apical tissues and tap root. The fact that that the apical leaf and stems together with the inflorescences were d13C depleted, suggests that those tissues were newly formed and had a larger sink strength and metabolic activity. Secondly, the analyses of δ13C of respired CO2 immediately after the labelling (T=0) showed that a significant part of the C respired by leaves and nodules proceeded of the recently fixed CO2. In the following harvests (T=7 and T=14) such percentage tended to decrease, especially in apical leaves. Interestingly, the respiration d13C data also highlighted that even if at T=0 part of the respired proceeded from the CO2 fixed during the labelling, this percentage was even larger at T=7. Finally, the d15N also revealed that, similarly to what described for 12C, immediately after the 15N2 labelling (T=0), apical leaf and stems, together with tap root and in this case the nodules, were the tissues with larger sink strength. It is noteworthy the fact that the largest amount of N2 newly fixed was delivered to the tap roots where it was stored until it was required for the aboveground regrowth period.; Estudi realitzat a partir d’una estada a la Universite Paris Sud – XI, França, entre juliol i octubre del 2007. La relació entre la fotosíntesis i la respiració va ser estudiada en plantes cultivades utilitzant isòtops estables de carboni i nitrogen, en plantes sotmeses a condicions òptimes de rec i plantes estressades hidricament. Els experiments es van realitzar de Juliol a Octubre 2007. L’anàlisi de la composició isotòpica (δ13C) de la matèria orgànica total (TOM) recentment fixades per les plantes ben regades va demostrar que el carboni nou va ser enviat als teixits apicals i a l’arrel gruixuda. Com que les fulles apicals i les tiges junt amb les inflorescències estaven empobrides en d13C suggereix que aquest teixits van tenir un important paper com ambornals (sumides). En segon lloc, l’anàlisi del δ13C del CO2 respirat immediatament després del marcatge (T=0) demostra que una part important del C respirat per les fulles i els nòduls procedeix del recentment ficat per la fotosíntesis. En les següents collites (T=7 i T=14) aquest percentatge tendeix a disminuir , especialment en les fulles apicals. Es interessant destacar que el d13C de la respiració, encara que T=0 part del CO2 respirat procedeix del CO2 fixat durant la fotosíntesis, aquest percentatge augmenta a T=7. Finalment, el d15N demostra que, de manera similar al mencionat pel 12C, immediatament després del marcatge 15N2 (T=0), les fulles apicals i les tiges, juntament amb l’arrel principal i les nòduls, van ser els teixits amb més força com ambornal (sumides). Cal destacar que el N2 fixats pels nòduls va ser enviat a l’arrel principal on va ser guardat fins que va ser utilitzat pel rebrotament de la part aèria de les plantes. Mon, 01 Jan 2007 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/15535 2007-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/15528 Caraterización y uso de pantallas de cristal líquido para diferentes aplicaciones Iemmi, Claudio Proyecto de investigación realizado a partir de una estancia en el Departamento de Física de la Universidad Autònoma de Barcelona entre octubre de 2007 y febrero del 2008. La investigación realizada se ha centrado en la caracterización y uso en diferentes aplicaciones de pantallas de cristal líquido por reflexión. Las fluctuaciones temporales de la modulación de estos dispositivos origina una despolarización parcial de la luz transmitida. Por ello para su caracterización se ha utilizado el formalismo de Mueller-Stokes. Se ha desarrollado un montaje experimental para la caracterización y se ha propuesto un modelo para predecir tanto su modulación en maplictud come en fase y polarización. También se ha estudiado la variación del comportamiento en función de la longitud de onda utilizada y del ángulo de incidencia. La respuesta de los sistemas ópticos en cuanto a su profundidad de enfoque y su resolución puede ser modificada mediante filtros de transmisión no uniforme. Hemos estudiado la capacidad de las pantallas de cristal líquido para implementar este tipo de filtros. Se han estudiado los efectos de diferentes tipos de filtros tanto teóricamente como experimentalmente. Se han diseñado sistemas ópticos telescópicos utilizando dos pantallas de cristal líquido. En estos sistemas se puede variar el aumento en tiempo real. Debido a la versatilidad que ofrecen las pantallas de cristal líquido se pueden implementar lentes cilíndricas con lo que se pueden variar los aumentos en cada una de las direcciones, formando así un procesador anamórfico programable. Por último se ha propuesto un procesador óptico de polarización. Las pantallas de cristal líquido cambian el estado de polarización de la luz incidente, lo que da lugar a la posibilidad de modular espacialmente el estado de polarización. Se han estudiado teóricamente y experimentalmente la propagación de estos haces. Thu, 01 Jan 2009 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/15528 2009-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/15524 Solid-phase synthesis and NMR studies of modified oligonucleotides forming triplex helix and of oligonucleopeptides mimicking the topoisomerase I-DNA covalent complex Mazzini, Stefania Report for the scientific sojourn carried out at the Institut de Biologia Molecular de Barcelona of the CSIC –state agency – from april until september 2007. Topoisomerase I is an essential nuclear enzyme that modulates the topological status of DNA, facilitating DNA helix unwinding during replication and transcription. We have prepared the oligonucleotide-peptide conjugate Ac-NLeu-Asn-Tyr(p-3’TTCAGAAGC5’)-LeuC-CONH-(CH2)6-OH as model compound for NMR studies of the Topoisomerase I- DNA complex. Special attention was made on the synthetic aspects for the preparation of this challenging compound especially solid supports and protecting groups. The desired peptide was obtained although we did not achieve the amount of the conjugate needed for NMR studies. Most probably the low yield is due to the intrinsic sensitive to hydrolysis of the phosphate bond between oligonucleotide and tyrosine. We have started the synthesis and the structural characterization of oligonucleotides carrying intercalating compounds. At the present state we have obtained model duplex and quadruplex sequences modified with acridine and NMR studies are underway. In addition to this project we have successfully resolved the structure of a fusion peptide derived from hepatitis C virus envelope synthesized by the group of Dr. Haro and we have synthesized and started the characterization of a modified G-quadruplex.; Estudi realitzat a partir d’una estada al Institut de Biologia Molecular de Barcelona pertranyent CSIC, entre abril i setembre del 2007. La Topoisomerasa I és un enzim nuclear que modula els estats topològics del DNA, facilitant el desenrotllament de l’hèlix de DNA durant la replicació i la transcripció. En aquest projecte hem preparat el oligonucleòtid-pèptid conjugat Ac-NLeu-Asn-Tyr(p-3’TTCAGAAGC5’)-LeuC-CONH-(CH2)6-OH per fer-lo servir en estudis de RMN com a compost model del complexe Topoisomerase I- DNA. Hem prestat una atenció especial en els aspectes sintètics necessaris per a l’obtenció d’aquest producte difícil de preparar, especialment pel que fa a la utilització de suports sòlids i grups protectors. El producte desitjat es va obtenir però no hem pogut disposar de quantitat necessària per la seva carateritzaciò estructural per RMN. Probablement els baixos rendiments obtinguts sòn deguts a la sensibilitat a la hidròlisis de l’enllaç entre l’oligonucleòtid i la tirosina. Hem iniciat la síntesi i caracterització estructural d’oligonucleòtids que contenen agents intercalants. En aquest moment hem obtingut seqüències models de dúplexs i quàdruplexs modificades amb acridina i el estudis per RMN estan en procés. A més hem resolt amb èxit l’estructura d’un pèptid de fusió derivat de la càpsula del virus de hepatitis C sintetitzar pel grup de la Dra Haro i hem sintetitzat i parcialment caracteritzat un G-quadruplex modificat. Mon, 01 Jan 2007 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/15524 2007-01-01T00:00:00Z http://www.recercat.cat:80/handle/2072/15523 Estudi teòric pràctic de la solubilitat de noves mescles aquoses de nitrats alcalins per climatització per absorció accionada tèrmicament a alta temperatura Galleguillos Castro, Héctor René Investigación realizada a partir de una estancia como profesor visitante en el Departamento de Ingeniería Mecánica de la Universitat Rovira i Virgili. Las soluciones acuosas de LiNO3 tienen una gran potencialidad para ser utilizadas como fluidos de trabajo en ciclos de absorción a altas temperaturas. La adición de otros nitratos y/o nitritos alcalinos mejora, entre otras propiedades, su solubilidad en H2O, el principal inconveniente de estas soluciones. La información bibliográfica sobre la solubilidad de estas es prácticamente inexistente, por eso, en este trabajo se ha realizado un estudio teórico-práctico de la solubilidad de algunos de estos sistemas.(...); Report for the scientific sojourn carried out at the Department of Mechanical Engineering at the Universitat Rovira i Virgili from february until august 2007.The aqueous solutions of LiNO3 have great potential to be used as working fluids in absorption refrigeration cycles at high temperatures. The addition of other alkaline nitrate and/or nitrite improves, among other properties, its solubility in H2O, the main disadvantage of these solutions. The literature data about the solubility of these mixtures is scarce, so in this work a theoretical and experimental study about the solubility of some of these systems has been carried out.(...) Mon, 01 Jan 2007 00:00:00 GMT http://www.recercat.cat:80/handle/2072/15523 2007-01-01T00:00:00Z